Sous le régime de Vichy, le « Journal officiel » s'intitule « Journal officiel de l'Etat français ». Il est publié successivement à Tours, Pau, puis, du 1er juillet 1940 au 21 Août 1944, à Vichy. Sous la IVe République, il reparaît ensuite à Paris en une édition unique dès le 8 septembre 1944. Depuis, il n'a pas subi de changement majeur.

Durant la période de l'Occupation allemande, le gouvernement de Vichy a édicté plusieurs lois sur le statut des Juifs. Dès octobre 1940 le premier statut des Juifs crée des conditions discriminatoires à leur égard : de nombreuses professions leur sont désormais interdites, ils sont exclus des principaux corps de la fonction publique, notamment de l’enseignement, un numerus clausus est établi à l’université et dans certaines professions libérales (médecins, architectes, avocats). Préalablement, l’article 1 donne les critères d’appartenance à la communauté juive : « trois grands-parents de race juive ou deux si le conjoint est lui-même juif ».